Captain Tsubasa: Rise of New Champions avrà una Modalità Storia, chiamata Tsubasa Episode, che permetterà ai giocatori di rivivere la celebre storia di Tsubasa Ozora.

Questa modalità coprirà l’intero torneo nazionale delle scuole medie e includerà alcuni delle più epiche partite della serie originale.

Grandi rivali torneranno in campo con le loro migliori mosse: 

• Mitsuru Sano
• Hiroshi Jito
• Il gemelli Tachibana
• Shun Nitta
• Ryo Ishizaki
• Mamoru Izawa
• Yuzo Morisaki
• Takeshi Sawada
• Kazuki Sorimachi
• Shingo Takasugi
• Hajime Taki
• Ken Wakashimazu
• ...

A seconda del punteggio e dell’andamento del match potranno sbloccarsi determinati video, alcuni riproponendo precisamente la storia, altri con sorprese completamente nuove.